科研進(jìn)展
動(dòng)物生態(tài)與資源保護研究團隊在藏羊高繁殖力性狀研究中取得新進(jìn)展
藏羊(Tibetan sheep)是我國三大粗毛綿羊品種之一,產(chǎn)于青藏高原及其毗鄰地區,對高原極端環(huán)境有著(zhù)很好的適應能力,是經(jīng)過(guò)長(cháng)期自然選擇和人工培育形成的優(yōu)良品種。它具有抗旱、抗寒、抗病強、耐粗飼、遺傳穩定等一系列優(yōu)良特性。然而,藏羊同時(shí)具有性成熟較晚、繁殖性能和生產(chǎn)力較低的不足。這些不足極大地限制了藏羊養殖的提質(zhì)增效和產(chǎn)業(yè)競爭力。在以生產(chǎn)為導向的育種過(guò)程中,自然選擇和人工選擇極大地改變了綿羊的基因組變異水平。挖掘綿羊高繁殖性的候選基因一直是遺傳育種研究者所追求的目標。
中國科學(xué)院西北高原生物研究所動(dòng)物生態(tài)與資源保護研究團隊針對綿羊重要繁殖性狀(產(chǎn)羔數和產(chǎn)羔間隔),以連續三個(gè)產(chǎn)羔季節產(chǎn)多胎(每胎產(chǎn)兩羔或三羔,HF)和產(chǎn)單胎(每胎產(chǎn)一羔,LF)的藏羊為研究對象,整合全基因組關(guān)聯(lián)分析、普通轉錄組學(xué)、單細胞轉錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等多組學(xué)研究方法,結合KASP基因分型、實(shí)時(shí)熒光定量PCR、酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗、免疫共沉淀和蛋白質(zhì)免疫印跡等分子功能驗證實(shí)驗,挖掘藏羊產(chǎn)羔數和產(chǎn)羔間隔關(guān)鍵調控元件并揭示其高繁殖力的遺傳調控機制。全基因組關(guān)聯(lián)研究表明,BMPR1B基因與產(chǎn)羔數性狀相關(guān),PAPPA基因與產(chǎn)羔間隔性狀相關(guān)。首次構建了藏羊卵巢單細胞圖譜,發(fā)現關(guān)鍵基因PAPPA特異性表達在壁層顆粒細胞亞群,且BMPR1B基因在壁層顆粒細胞和固醇生成顆粒亞群高表達?;趩渭毎D錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)整合分析,發(fā)現PAPPA是刺激卵巢優(yōu)勢卵泡生長(cháng)發(fā)育和類(lèi)固醇生成的關(guān)鍵候選基因。繁殖主效基因BMPR1B除了非同義突變,首次在藏羊中發(fā)現BMPR1B還存在可變剪接事件調控多胎性狀。該研究結果對分子精準選育提升藏羊繁殖力和實(shí)現藏羊產(chǎn)業(yè)提質(zhì)增效具有重要意義。
相關(guān)研究結果以Multiomics analyses provide new insight into genetic variation of reproductive adaptability in Tibetan sheep為題,于3月29日在國際期刊Molecular Biology and Evolution(中國科學(xué)院1區TOP期刊)正式發(fā)表。西北高原所為獨立完成單位,博士研究生韓步鷹為論文第一作者,趙凱研究員為通訊作者。該研究得到青海省自然科學(xué)基金計劃(2022-ZJ-901)、青藏高原第二次科學(xué)考察(2019QZKK0501)、中國科學(xué)院戰略性先導科技專(zhuān)項(XDA2004010303)、國家育種聯(lián)合攻關(guān)項目等資助。
論文連接:https://doi.org/10.1093/molbev/msae058
圖1?BMPR1B的突變和互斥外顯子事件是藏羊連續產(chǎn)多胎的潛在調控機制
圖2?藏羊卵泡生長(cháng)和排卵生殖候選基因的主要途徑