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科研進(jìn)展

西北高原所在藏羊遺傳多樣性及高原適應研究中取得新進(jìn)展

發(fā)表日期:2024-12-23來(lái)源:西北高原生物研究所放大 縮小

藏羊(Tibetan?sheep)是青藏高原地區重要經(jīng)濟動(dòng)物,因其耐寒冷、耐低氧和抗病力強等高原適應特性,為高原地區農牧業(yè)經(jīng)濟發(fā)展提供了重要支持。經(jīng)過(guò)長(cháng)期的環(huán)境適應和人工選擇,藏羊在青藏高原獨特的自然條件下已經(jīng)馴化出十多個(gè)品種,其中青海省內的主要品種包括高原型藏羊、山谷型藏羊、歐拉型藏羊、貴南黑裘皮羊、扎什加羊和澤庫羊。然而,到目前關(guān)于藏羊的遺傳多樣性與馴化機制的研究還不夠深入。?

中國科學(xué)院西北高原生物研究所動(dòng)物生態(tài)與資源保護研究團隊對青海省6個(gè)藏羊品種進(jìn)行全基因組重測序。以盤(pán)羊為野生外類(lèi)群,采用主成分分析、系統發(fā)育樹(shù)、遺傳結構、基因流、連鎖不平衡、祖先血緣分析等方法,首次系統性地揭示了青海省藏羊的遺傳結構與遺傳多樣性。研究結果表明,6個(gè)藏羊品種在系統發(fā)育樹(shù)中能明顯區分,盤(pán)羊和青海藏羊在同時(shí)期發(fā)生分化,各品種間存在廣泛的基因交流現象?;贏(yíng)DMIXTURE分析,當祖先群體數K=2時(shí),盤(pán)羊和藏羊追溯到不同的祖先譜系;當K=4時(shí),可以推斷出青海藏羊有三個(gè)主要祖先血緣。

盤(pán)羊和藏羊特異的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)和選擇性清除分析結果表明,藏羊在馴化過(guò)程中,由于飼養條件的改變,以及人工選擇下對高生產(chǎn)性能選擇的影響,藏羊在感覺(jué)功能(嗅覺(jué)、味覺(jué))、營(yíng)養物質(zhì)代謝及生長(cháng)發(fā)育等生理功能方面發(fā)生了顯著(zhù)改變。

動(dòng)物對極端環(huán)境的適應已成為近年來(lái)研究的熱點(diǎn)。多數高原適應研究以分布于平原與高原的動(dòng)物為研究對象,而本研究以分布于高原地區不同海拔梯度的扎什加羊(海拔4300米)和山谷型藏羊(海拔1800米)為研究對象,通過(guò)選擇性消除分析、肺臟和肝臟轉錄組學(xué)分析,首次探討了藏羊在高原上不同海拔梯度的適應機制。研究結果發(fā)現,藏羊可能通過(guò)減少脂質(zhì)代謝、增強血管平滑肌和心臟收縮能力、調節體液平衡、提升免疫功能及抗氧化應激能力等生理功能適應極端高原環(huán)境。本研究為全面理解藏羊遺傳資源及其高原適應機制提供了新的視角,同時(shí)為高原生物的適應性進(jìn)化研究提供了重要科學(xué)依據。

相關(guān)研究結果以?Whole-genome resequencing to investigate the genetic diversity and mechanisms of plateau adaptation in Tibetan sheep?為題,于12月6日發(fā)表在國際期刊?Journal of Animal Science and Biotechnology(中國科學(xué)院1區TOP期刊,2023年影響因子/JCR分區:6.3/Q1)。西北高原所特別研究助理李雪為論文第一作者,田得紅為通訊作者。該研究得到了青海省自然科學(xué)基金計劃(2022-ZJ-901)和國家藏羊育種聯(lián)合攻關(guān)項目共同資助。

論文連接:https://doi.org/10.1186/s40104-024-01125-1 

青海藏羊的種群結構及系統發(fā)育關(guān)系

扎什加羊和山谷型藏羊肺臟轉錄組結果

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